Plusieurs outils spécifiques à Natura 2000 existent pour mettre en oeuvre les actions du DOCOB :
- Les contrats Natura 2000
- Les chartes Natura 2000
- Les MAEC : Mesures agro-environnementales et climatiques
La Circulaire du 27 avril 2012 relative à la gestion contractuelle des sites Natura 2000 majoritairement terrestres en application des articles R. 414-8 à 18 du code de l’environnement précise ces différents outils et leur cadrage réglementaire.
D’autres outils complémentaires peuvent également contribuer à la restauration et à la gestion des habitats et des espèces d’intérêt communautaire :
- L’intervention du Conservatoire du Littoral (travaux)
- L’intervention des collectivités (gestion partenariale)
- Les conventions départementales Armor-Nature
- Les contrats nature régionaux
- Les plans nationaux d’action pour certaines espèces
- Projets LEADER, Life +...